Get minimal depth values for all trees in a random forest

min_depth_distribution(forest)

Arguments

forest

A randomForest or ranger object

Value

A data frame with the value of minimal depth for every variable in every tree

Examples

min_depth_distribution(randomForest::randomForest(Species ~ ., data = iris, ntree = 100))
#>     tree     variable minimal_depth
#> 1      1 Petal.Length             0
#> 2      1  Petal.Width             2
#> 3      1 Sepal.Length             2
#> 4      2 Petal.Length             2
#> 5      2  Petal.Width             1
#> 6      2 Sepal.Length             0
#> 7      2  Sepal.Width             2
#> 8      3 Petal.Length             3
#> 9      3  Petal.Width             1
#> 10     3 Sepal.Length             0
#> 11     3  Sepal.Width             2
#> 12     4 Petal.Length             0
#> 13     4  Petal.Width             2
#> 14     4 Sepal.Length             3
#> 15     5 Petal.Length             0
#> 16     5  Petal.Width             2
#> 17     5 Sepal.Length             2
#> 18     5  Sepal.Width             3
#> 19     6 Petal.Length             0
#> 20     6  Petal.Width             2
#> 21     7 Petal.Length             2
#> 22     7  Petal.Width             0
#> 23     7 Sepal.Length             4
#> 24     7  Sepal.Width             3
#> 25     8 Petal.Length             0
#> 26     8  Petal.Width             4
#> 27     8 Sepal.Length             4
#> 28     8  Sepal.Width             2
#> 29     9 Petal.Length             3
#> 30     9  Petal.Width             0
#> 31     9 Sepal.Length             2
#> 32     9  Sepal.Width             3
#> 33    10 Petal.Length             2
#> 34    10  Petal.Width             0
#> 35    10 Sepal.Length             1
#> 36    10  Sepal.Width             2
#> 37    11 Petal.Length             1
#> 38    11  Petal.Width             1
#> 39    11 Sepal.Length             0
#> 40    11  Sepal.Width             5
#> 41    12 Petal.Length             5
#> 42    12  Petal.Width             0
#> 43    12 Sepal.Length             2
#> 44    12  Sepal.Width             4
#> 45    13 Petal.Length             0
#> 46    13  Petal.Width             2
#> 47    14 Petal.Length             2
#> 48    14  Petal.Width             0
#> 49    14 Sepal.Length             2
#> 50    15 Petal.Length             4
#> 51    15  Petal.Width             0
#> 52    15 Sepal.Length             2
#> 53    16 Petal.Length             0
#> 54    16  Petal.Width             1
#> 55    16 Sepal.Length             2
#> 56    17 Petal.Length             2
#> 57    17  Petal.Width             0
#> 58    17 Sepal.Length             2
#> 59    18 Petal.Length             0
#> 60    18  Petal.Width             2
#> 61    18 Sepal.Length             4
#> 62    18  Sepal.Width             3
#> 63    19 Petal.Length             1
#> 64    19  Petal.Width             0
#> 65    19 Sepal.Length             2
#> 66    19  Sepal.Width             4
#> 67    20 Petal.Length             1
#> 68    20  Petal.Width             0
#> 69    20 Sepal.Length             4
#> 70    20  Sepal.Width             3
#> 71    21 Petal.Length             2
#> 72    21  Petal.Width             0
#> 73    21  Sepal.Width             3
#> 74    22 Petal.Length             3
#> 75    22  Petal.Width             0
#> 76    22 Sepal.Length             2
#> 77    23  Petal.Width             0
#> 78    23  Sepal.Width             2
#> 79    24 Petal.Length             2
#> 80    24  Petal.Width             0
#> 81    24  Sepal.Width             3
#> 82    25 Petal.Length             0
#> 83    25  Petal.Width             1
#> 84    26 Petal.Length             0
#> 85    26  Petal.Width             2
#> 86    26 Sepal.Length             2
#> 87    27 Petal.Length             0
#> 88    27  Petal.Width             2
#> 89    27 Sepal.Length             2
#> 90    28 Petal.Length             0
#> 91    28  Petal.Width             1
#> 92    28 Sepal.Length             2
#> 93    28  Sepal.Width             3
#> 94    29 Petal.Length             2
#> 95    29  Petal.Width             0
#> 96    30 Petal.Length             0
#> 97    30  Petal.Width             3
#> 98    30 Sepal.Length             1
#> 99    30  Sepal.Width             3
#> 100   31 Petal.Length             0
#> 101   31  Petal.Width             1
#> 102   31  Sepal.Width             3
#> 103   32 Petal.Length             3
#> 104   32  Petal.Width             0
#> 105   32 Sepal.Length             2
#> 106   32  Sepal.Width             4
#> 107   33 Petal.Length             0
#> 108   33  Petal.Width             1
#> 109   33 Sepal.Length             2
#> 110   33  Sepal.Width             3
#> 111   34 Petal.Length             2
#> 112   34  Petal.Width             0
#> 113   34 Sepal.Length             1
#> 114   35 Petal.Length             0
#> 115   35  Petal.Width             1
#> 116   35  Sepal.Width             3
#> 117   36 Petal.Length             0
#> 118   36  Petal.Width             1
#> 119   36 Sepal.Length             2
#> 120   36  Sepal.Width             3
#> 121   37 Petal.Length             3
#> 122   37  Petal.Width             0
#> 123   37 Sepal.Length             3
#> 124   37  Sepal.Width             1
#> 125   38 Petal.Length             3
#> 126   38  Petal.Width             0
#> 127   38 Sepal.Length             1
#> 128   38  Sepal.Width             2
#> 129   39 Petal.Length             1
#> 130   39  Petal.Width             1
#> 131   39 Sepal.Length             0
#> 132   40 Petal.Length             1
#> 133   40  Petal.Width             0
#> 134   40 Sepal.Length             2
#> 135   40  Sepal.Width             2
#> 136   41 Petal.Length             2
#> 137   41  Petal.Width             3
#> 138   41 Sepal.Length             0
#> 139   41  Sepal.Width             1
#> 140   42 Petal.Length             1
#> 141   42  Petal.Width             0
#> 142   43 Petal.Length             2
#> 143   43  Petal.Width             0
#> 144   43 Sepal.Length             3
#> 145   43  Sepal.Width             2
#> 146   44 Petal.Length             2
#> 147   44  Petal.Width             0
#> 148   44 Sepal.Length             2
#> 149   44  Sepal.Width             3
#> 150   45 Petal.Length             1
#> 151   45  Petal.Width             0
#> 152   46 Petal.Length             0
#> 153   46  Petal.Width             1
#> 154   46 Sepal.Length             2
#> 155   46  Sepal.Width             3
#> 156   47 Petal.Length             2
#> 157   47  Petal.Width             1
#> 158   47 Sepal.Length             0
#> 159   47  Sepal.Width             1
#> 160   48 Petal.Length             0
#> 161   48  Petal.Width             1
#> 162   48  Sepal.Width             3
#> 163   49 Petal.Length             0
#> 164   49  Petal.Width             1
#> 165   49 Sepal.Length             3
#> 166   49  Sepal.Width             4
#> 167   50 Petal.Length             3
#> 168   50  Petal.Width             0
#> 169   50 Sepal.Length             2
#> 170   50  Sepal.Width             2
#> 171   51 Petal.Length             1
#> 172   51  Petal.Width             0
#> 173   51 Sepal.Length             3
#> 174   51  Sepal.Width             2
#> 175   52 Petal.Length             1
#> 176   52  Petal.Width             1
#> 177   52 Sepal.Length             0
#> 178   52  Sepal.Width             4
#> 179   53 Petal.Length             0
#> 180   53  Petal.Width             2
#> 181   53 Sepal.Length             1
#> 182   54 Petal.Length             0
#> 183   54  Petal.Width             1
#> 184   54 Sepal.Length             2
#> 185   54  Sepal.Width             2
#> 186   55 Petal.Length             0
#> 187   55  Petal.Width             2
#> 188   55 Sepal.Length             1
#> 189   56 Petal.Length             0
#> 190   56  Petal.Width             3
#> 191   56 Sepal.Length             2
#> 192   56  Sepal.Width             5
#> 193   57 Petal.Length             1
#> 194   57  Petal.Width             1
#> 195   57 Sepal.Length             0
#> 196   57  Sepal.Width             2
#> 197   58 Petal.Length             1
#> 198   58  Petal.Width             1
#> 199   58 Sepal.Length             0
#> 200   58  Sepal.Width             2
#> 201   59 Petal.Length             0
#> 202   59  Petal.Width             1
#> 203   59 Sepal.Length             3
#> 204   59  Sepal.Width             4
#> 205   60 Petal.Length             2
#> 206   60  Petal.Width             0
#> 207   60 Sepal.Length             2
#> 208   60  Sepal.Width             3
#> 209   61 Petal.Length             0
#> 210   61  Petal.Width             3
#> 211   61 Sepal.Length             1
#> 212   62 Petal.Length             1
#> 213   62  Petal.Width             2
#> 214   62 Sepal.Length             0
#> 215   62  Sepal.Width             1
#> 216   63 Petal.Length             3
#> 217   63  Petal.Width             0
#> 218   63 Sepal.Length             3
#> 219   63  Sepal.Width             2
#> 220   64 Petal.Length             0
#> 221   64  Petal.Width             1
#> 222   64 Sepal.Length             2
#> 223   64  Sepal.Width             3
#> 224   65 Petal.Length             1
#> 225   65  Petal.Width             0
#> 226   65  Sepal.Width             4
#> 227   66 Petal.Length             1
#> 228   66  Petal.Width             0
#> 229   66 Sepal.Length             2
#> 230   67 Petal.Length             0
#> 231   67  Petal.Width             1
#> 232   68 Petal.Length             0
#> 233   68  Petal.Width             1
#> 234   68 Sepal.Length             2
#> 235   69 Petal.Length             1
#> 236   69  Petal.Width             2
#> 237   69 Sepal.Length             0
#> 238   69  Sepal.Width             1
#> 239   70 Petal.Length             2
#> 240   70  Petal.Width             0
#> 241   70 Sepal.Length             1
#> 242   71 Petal.Length             1
#> 243   71  Petal.Width             2
#> 244   71 Sepal.Length             0
#> 245   71  Sepal.Width             2
#> 246   72 Petal.Length             1
#> 247   72  Petal.Width             0
#> 248   72 Sepal.Length             3
#> 249   73 Petal.Length             2
#> 250   73  Petal.Width             0
#> 251   73 Sepal.Length             1
#> 252   73  Sepal.Width             3
#> 253   74 Petal.Length             1
#> 254   74  Petal.Width             0
#> 255   74 Sepal.Length             3
#> 256   75 Petal.Length             0
#> 257   75  Petal.Width             2
#> 258   75 Sepal.Length             3
#> 259   75  Sepal.Width             3
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